sadece kadınların kullanabildiği "is" yani infinite stratos ismi verilen makinelerden birisini bir gün ichika isimli bir erkek de kullanmaya başlar. herkes büyük bir şok yaşar ve ichika, dünyanın her yanından gelen kız öğrencilerle birlikte is eğitimi veren özel bir okulda eğitim görmeye başlar. herkesin kız olduğu bir ortamda tek erkek olan ichika, tüm öğrencilerin gözdesidir ve herkes onun peşindedir. böylece macera başlar. seri mecha bir seri olup harem ve azıcık da olsa ecchi barındırır.